» » » » Евгений Кунин - Логика случая. О природе и происхождении биологической эволюции

Евгений Кунин - Логика случая. О природе и происхождении биологической эволюции

На нашем литературном портале можно бесплатно читать книгу Евгений Кунин - Логика случая. О природе и происхождении биологической эволюции, Евгений Кунин . Жанр: Биология. Онлайн библиотека дает возможность прочитать весь текст и даже без регистрации и СМС подтверждения на нашем литературном портале litmir.org.
Евгений Кунин - Логика случая. О природе и происхождении биологической эволюции
Название: Логика случая. О природе и происхождении биологической эволюции
ISBN: -
Год: -
Дата добавления: 15 февраль 2019
Количество просмотров: 454
Читать онлайн

Внимание! Книга может содержать контент только для совершеннолетних. Для несовершеннолетних просмотр данного контента СТРОГО ЗАПРЕЩЕН! Если в книге присутствует наличие пропаганды ЛГБТ и другого, запрещенного контента - просьба написать на почту readbookfedya@gmail.com для удаления материала

Логика случая. О природе и происхождении биологической эволюции читать книгу онлайн

Логика случая. О природе и происхождении биологической эволюции - читать бесплатно онлайн , автор Евгений Кунин
В этой амбициозной книге Евгений Кунин освещает переплетение случайного и закономерного, лежащих в основе самой сути жизни. В попытке достичь более глубокого понимания взаимного влияния случайности и необходимости, двигающих вперед биологическую эволюцию, Кунин сводит воедино новые данные и концепции, намечая при этом дорогу, ведущую за пределы синтетической теории эво люции. Он интерпретирует эволюцию как стохастический процесс, основанный на заранее непредвиденных обстоятельствах, ограниченный необходимостью поддержки клеточной организации и направляемый процессом адаптации. Для поддержки своих выводов он объединяет между собой множество концептуальных идей: сравнительную геномику, проливающую свет на предковые формы; новое понимание шаблонов, способов и непредсказуемости процесса эволюции; достижения в изучении экспрессии генов, распространенности белков и других фенотипических молекулярных характеристик; применение методов статистической физики для изучения генов и геномов и новый взгляд на вероятность самопроизвольного появления жизни, порождаемый современной космологией.Логика случая демонстрирует, что то понимание эволюции, которое было выработано наукой XX века, является устаревшим и неполным, и обрисовывает фундаментально новый подход – вызывающий, иногда противоречивый, но всегда основанный на твердых научных знаниях.
Перейти на страницу:
Конец ознакомительного фрагментаКупить книгу

Ознакомительная версия. Доступно 19 страниц из 125

Charlebois, R. L., and W. F. Doolittle. (2004) Computing Prokaryotic Gene Ubiquity: Rescuing the Core from Extinction. Genome Res 14: 2,469—2,477.

Chen, I., P. J. Christie, and D. Dubnau. (2005) The Ins and Outs of DNA Transfer in Bacteria. Science 310: 1,456—1,460.

Cheng, L. K., and P. J. Unrau. (2010) Closing the Circle: Replicating RNA with RNA. Cold Spring Harb Perspect Biol 2: a002204.

Chernikova, D., S. Motamedi, M. Csuros, E. V. Koonin, and I. B. Rogozin. (2011) A Late Origin of the Extant Eukaryotic Diversity: Divergence Time Estimates Using Rare Genomic Changes. Biol Direct, in press.

Ciccarelli, F. D., T. Doerks, C. von Mering, C. J. Creevey, B. Snel, and P. Bork. (2006) Toward Automatic Reconstruction of a Highly Resolved Tree of Life. Science 311: 1,283—1,287.

Clapier, C. R., and B. R. Cairns. (2009) The Biology of Chromatin Remodeling Complexes. Annu Rev Biochem 78: 273–304.

Claverie, J. M. (2006) Viruses Take Center Stage in Cellular Evolution. Genome Biol 7: 110.

Collins, L., and D. Penny. (2005) Complex Spliceosomal Organization Ancestral to Extant Eukaryotes. Mol Biol Evol 22: 1,053—1,066.

Cortez, D., P. Forterre, and S. Gribaldo. (2009) A Hidden Reservoir of Integrative Elements Is the Major Source of Recently Acquired Foreign Genes and Orfans in Archaeal and Bacterial Genomes. Genome Biol 10: R65.

Costanzo, G., S. Pino, F. Ciciriello, and E. Di Mauro. (2009) Generation of Long RNA Chains in Water. J Biol Chem 284: 33,206—33,216.

Costanzo, G., R. Saladino, C. Crestini, F. Ciciriello, and E. Di Mauro. (2007) Nucleoside Phosphorylation by Phosphate Minerals. J Biol Chem 282: 16,729—16,735.

Cox, C. J., P. G. Foster, R. P. Hirt, S. R. Harris, and T. M. Embley. (2008) The Archaebacterial Origin of Eukaryotes. Proc Natl Acad Sci USA 105: 20,356—20,361.

Cox, M. M., and J. R. Battista. (2005) Deinococcus Radiodurans – the Consummate Survivor. Nat Rev Microbiol 3: 882–892.

Crick, F. (1970) Central Dogma of Molecular Biology. Nature 227: 561–563.

Crick, F. H. (1958) On Protein Synthesis. Symp Soc Exp Biol 12: 138–163.

Crick, F. H. (1968) The Origin of the Genetic Code. J Mol Biol 38: 367–379.

Csuros, M., and I. Miklos. (2009) Streamlining and Large Ancestral Genomes in Archaea Inferred with a Phylogenetic Birth-and-Death Model. Mol Biol Evol 26: 2,087—2,095.

Csuros, M., I. B. Rogozin, and E. V. Koonin. (2011) Resonstructed HumanLike Intron Density in the Last Common Ancestor of Eukaryotes. PLoS Comput Biol, in press.

D’Herelle, F. (1922). The Bacteriophage; Its Role in Immunity. Baltimore: Williams and Wilkins. Dagan, T., and W. Martin. (2006) The Tree of One Percent. Genome Biol 7: 118.

Daly, M. J. (2009) A New Perspective on Radiation Resistance Based on Deinococcus Radiodurans. Nat Rev Microbiol 7: 237–245.

Danchin, A. (2003). The Delphic Boat: What Genomes Tell Us. Cambridge, MA: Harvard Univ Press.

Darwin, C. (1859) On the Origin of Species. London: Murray. Darwin, C. (1872) Origin of Species. New York: The Modern Library.

Daubin, V., and H. Ochman. (2004) Bacterial Genomes As New Gene Homes: The Genealogy of Orfans in E. Coli. Genome Res 14: 1,036—1,042.

Davidov, Y., and E. Jurkevitch. (2009) Predation Between Prokaryotes and the Origin of Eukaryotes. Bioessays 31: 748–757.

Daviter, T., K. B. Gromadski, and M. V. Rodnina. (2006) The Ribosome’s Response to Codon-Anticodon Mismatches. Biochimie 88: 1,001—1,011.

Dawkins, R. (1996) The Blind Watchmaker: Why the Evidence of Evolution Reveals a Universe Without Design. London: W.W. Norton & Co.

Dawkins, R. (2006) The Selfish Gene: 30th Anniversary Edition – with a New Introduction by the Author. Oxford: Oxford University Press.

Dayhoff, M. O., W. C. Barker, and L. T. Hunt. (1983) Establishing Homologies in Protein Sequences. Methods Enzymol 91: 524–545.

de Nooijer, S., B. R. Holland, and D. Penny. (2009) The Emergence of Predators in Early Life: There Was No Garden of Eden. PLoS ONE 4: e5507.

de Souza, S. J., M. Long, R. J. Klein, S. Roy, S. Lin, and W. Gilbert. (1998) Toward a Resolution of the Introns Early/Late Debate: Only Phase Zero Introns Are Correlated with the Structure of Ancient Proteins. Proc Natl Acad Sci USA 95: 5,094—5,099.

de Visser, J. A., and S. F. Elena. (2007) The Evolution of Sex: Empirical Insights into the Roles of Epistasis and Drift. Nat Rev Genet 8: 139–149.

Deckert, G., P. V. Warren, T. Gaasterland, W. G. Young, A. L. Lenox, D. E. Graham, R. Overbeek, M. A. Snead, M. Keller, M. Aujay, R. Huber, R. A. Feldman, J. M. Short, G. J. Olsen, and R. V. Swanson. (1998) The Complete Genome of the Hyperthermophilic Bacterium Aquifex Aeolicus. Nature 392: 353–358.

Delarue, M., O. Poch, N. Tordo, D. Moras, and P. Argos. (1990) An Attempt to Unify the Structure of Polymerases. Protein Eng 3: 461–467.

Delaye, L., and A. Moya. (2010) Evolution of Reduced Prokaryotic Genomes and the Minimal Cell Concept: Variations on a Theme. Bioessays 32: 281–287.

Deleuze, G., and F. Guattari. (1987) Thousand Plateaus: Capitalism and Schizophrenia. Minneapolis, MN: University of Minnesota Press.

Denamur E. and I. Matic. (2006) Evolution of Mutation Rates in Bacteria. Mol Microbiol 60: 820–827.

Dennett, D. C. (1996) Darwin‘s Dangerous Idea: Evolution and the Meanings of Life. New York: Simon & Schuster.

Deppenmeier, U., A. Johann, T. Hartsch, R. Merkl, R. A. Schmitz, R. Martinez-Arias, A. Henne, A. Wiezer, S. Baumer, C. Jacobi, H. Bruggemann, T. Lienard, A. Christmann, M. Bomeke, S. Steckel, A. Bhattacharyya, A. Lykidis, R. Overbeek, H. P. Klenk, R. P. Gunsalus, H. J. Fritz, and G. Gottschalk. (2002) The Genome of Methanosarcina Mazei: Evidence for Lateral Gene Transfer Between Bacteria and Archaea. J Mol Microbiol Biotechnol 4: 453–461.

Deveau, H., J. E. Garneau, and S. Moineau. (2010) CRISPR/Cas System and Its Role in Phage-Bacteria Interactions. Annu Rev Microbiol 64: 475–493.

Diaz, R., C. Vargas-Lagunas, M. A. Villalobos, H. Peralta, Y. Mora, S. Encarnacion, L. Girard, and J. Mora. (2011) argC Orthologs from Rhizobiales Show Diverse Profiles of Transcriptional Efficiency and Functionality in Sinorhizobium Meliloti. J Bacteriol 193: 460–472.

Ding, S. W. (2010) RNA-Based Antiviral Immunity. Nat Rev Immunol 10: 632–644.

Dlakic, M. and A. Mushegian. (2011) Prp8, the Pivotal Protein of the Spliceosomal Catalytic Center, Evolved from a Retroelement-Encoded Reverse Transcriptase. RNA [Epub ahead of print].

Dobzhansky, T. (1951). Genetics and the Origin of Species. New York: Columbia University Press.

Dobzhansky, T. (1973) Nothing in Biology Makes Sense Except in the Light of Evolution. The American Biology Teacher 35: 125–129.

Dong, H., and C. G. Kurland. (1995) Ribosome Mutants with Altered Accuracy Translate with Reduced Processivity. J Mol Biol 248: 551–561.

Doolittle, R. F. (1995) The Multiplicity of Domains in Proteins. Annu Rev Biochem 64: 287–314.

Doolittle, W. F. (1999a) Lateral Genomics. Trends Cell Biol 9: M5—8.

Doolittle, W. F. (1999b) Phylogenetic Classification and the Universal Tree. Science 284: 2,124—2,129.

Doolittle, W. F. (2000) Uprooting the Tree of Life. Sci Am 282: 90–95.

Doolittle, W. F., and E. Bapteste. (2007) Pattern Pluralism and the Tree of Life Hypothesis. Proc Natl Acad Sci USA 104: 2,043—2,049.

Doolittle, W. F., and J. R. Brown. (1994) Tempo, Mode, the Progenote, and the Universal Root. Proc Natl Acad Sci USA 91: 6,721—6,728.

Doolittle, W. F., and C. Sapienza. (1980) Selfish Genes, the Phenotype Paradigm and Genome Evolution. Nature 284: 601–603.

Doolittle, W. F., and O. Zhaxybayeva. (2009) On the Origin of Prokaryotic Species. Genome Res 19: 744–756.

Doudna, J. A., and T. R. Cech. (2002) The Chemical Repertoire of Natural Ribozymes. Nature 418: 222–228.

Douzery, E. J., E. A. Snell, E. Bapteste, F. Delsuc, and H. Philippe. (2004) The Timing of Eukaryotic Evolution: Does a Relaxed Molecular Clock Reconcile Proteins and Fossils? Proc Natl Acad Sci USA 101: 15,386—15,391.

Draghi, J. A., T. L. Parsons, G. P. Wagner, and J. B. Plotkin. (2010) Mutational Robustness Can Facilitate Adaptation. Nature 463: 353–355.

Drake, J. W. (1991) A Constant Rate of Spontaneous Mutation in DNA-Based Microbes. Proc Natl Acad Sci USA 88: 7,160—7,164.

Drake, J. W., and J. J. Holland. (1999) Mutation Rates Among RNA Viruses. Proc Natl Acad Sci USA 96: 13,910—13,913.

Dronamraju, K. R., ed. (1968) Haldane and Modern Biology. Baltimore, Johns Hopkins University Press.

Drummond, D. A., J. D. Bloom, C. Adami, C. O. Wilke, and F. H. Arnold. (2005) Why Highly Expressed Proteins Evolve Slowly. Proc Natl Acad Sci USA 102: 14,338—14,343.

Drummond, D. A., A. Raval, and C. O. Wilke. (2006) A Single Determinant Dominates the Rate of Yeast Protein Evolution. Mol Biol Evol 23: 327–337.

Drummond, D. A., and C. O. Wilke. (2008) Mistranslation-Induced Protein Misfolding As a Dominant Constraint on Coding-Sequence Evolution. Cell 134: 341–352.

Drummond, D. A., and C. O. Wilke. (2009) The Evolutionary Consequences of Erroneous Protein Synthesis. Nat Rev Genet 10: 715–724.

Dupuy, C., E. Huguet, and J. M. Drezen. (2006) Unfolding the Evolutionary Story of Polydnaviruses. Virus Res 117: 81–89.

Echols, H. (1981) SOS Functions, Cancer, and Inducible Evolution. Cell 25: 1–2.

Eckerle, L. D., X. Lu, S. M. Sperry, L. Choi, and M. R. Denison. (2007) High Fidelity of Murine Hepatitis Virus Replication Is Decreased in nsp14 Exoribonuclease Mutants. J Virol 81: 12,135—12,144.

Eddy, S. R. (2002) Computational Genomics of Noncoding RNA Genes. Cell 109: 137–140.

Edwards, R. A., and F. Rohwer. (2005) Viral Metagenomics. Nat Rev Microbiol 3: 504–510.

Eigen, M. (1971) Self-organization of Matter and the Evolution of Biological Macromolecules. Naturwissenschaften 58: 465–523.

Eigen, M., B. F. Lindemann, M. Tietze, R. Winkler-Oswatitsch, A. Dress, and A. von Haeseler. (1989) How Old Is the Genetic Code? Statistical Geometry of tRNA Provides an Answer. Science 244: 673–679.

Eisen, J. A., J. F. Heidelberg, O. White, and S. L. Salzberg. (2000) Evidence for Symmetric Chromosomal Inversions Around the Replication Origin in Bacteria. Genome Biol 1: RESEARCH0011.

Eldredge, N., and S. J. Gould. (1997) On Punctuated Equilibria. Science 276: 338–341.

Ellington, A. D., X. Chen, M. Robertson, and A. Syrett. (2009) Evolutionary Origins and Directed Evolution of RNA. Int J Biochem Cell Biol 41: 254–265.

Ellis, R. J. (2003) Protein Folding: Importance of the Anfinsen Cage. Curr Biol 13: R881—883.

Embley, T. M., and W. Martin. (2006) Eukaryotic Evolution, Changes and Challenges. Nature 440: 623–630.

Esser, C., N. Ahmadinejad, C. Wiegand, C. Rotte, F. Sebastiani, G. Gelius-Dietrich, K. Henze, E. Kretschmann, E. Richly, D. Leister, D. Bryant, M. A. Steel, P. J. Lockhart, D. Penny, and W. Martin. (2004) A Genome Phylogeny for Mitochondria Among Alpha-Proteobacteria and a Predominantly Eubacterial Ancestry of Yeast Nuclear Genes. Mol Biol Evol 21: 1,643—1,660.

Esser, C., W. Martin, and T. Dagan. (2007) The Origin of Mitochondria in Light of a Fluid Prokaryotic Chromosome Model. Biol Lett 3: 180–184.

Falkowski, P. G., T. Fenchel, and E. F. Delong. (2008) The Microbial Engines That Drive Earth’s Biogeochemical Cycles. Science 320: 1,034—1,039.

Ознакомительная версия. Доступно 19 страниц из 125

Перейти на страницу:
Комментариев (0)